原則として代理人となる受入れ機関の所在地や親族の住所地を管轄する地方局又は支局その代理人となる受入れ機関の所在地や親族の住所を管轄する地方入国管理官署で申請してください。

http://www.immi-moj.go.jp/soshiki/index.html